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如果您的iPhone两部手机短信同步了，您可以采取以下步骤来取消同步并解决问题。
1、关闭iCloud同步：打开设置，点击顶部的账户名称，找到“iCloud”，关闭“信息”开关，这样，两部手机就不会通过iCloud共享短信了。
2、关闭iMessage信息：打开设置，点击“信息”，关闭iMessage开关，这样可以阻止两部手机通过iMessage相互发送和接收信息。
3、删除同步的短信：在其中一个手机上删除短信后，另一个手机上的短信也会同步删除，如果您不希望删除任何短信，请跳过这一步，如果您仍然想保留某些短信，可以在取消同步之前备份短信。
4、备份重要数据：如果您在取消同步之前想保留某些数据，可以使用iTunes或iCloud备份您的iPhone，这样，您可以保存您的短信、联系人和其他重要数据。
5、重置iPhone设置：如果以上步骤无法解决问题，您可以尝试将两部手机的设置重置为出厂设置，这将删除所有数据和设置，因此请在执行此操作之前备份您的数据。
步骤可能会因iOS版本和设备型号的不同而略有差异，如果您不确定如何操作，请查阅您的设备说明书或联系苹果客服寻求帮助。